Développements autour de l'assemblage

L’assemblage est le processus, complexe, de reconstruction de génomes. Lors du séminaire d’unité présenté par Clément Birbes, vous avez vu qu’il fait intervenir de nombreuses technologies, apportant chacune une information parcellaire, à assembler de façon à reconstruire l’intégralité du génome, qui dépasse, dans les cas d’intérêts, le milliard de nucléotides (les A, C, G, T du génome). Dans le cadre du projet SeqOccIn, nous vous présenterons les travaux en cours, qui ont pour but d’améliorer les outils d’assemblage. Nous avons travaillé sur deux parties: l’assemblage à partir de 10X, et l’intégration de données d’assemblage. Ces travaux seront présentés, comme il se doit, de façon très pédagogique.;;