Some examples of data integration

Alyssa Imbert


Date
01 avr. 2022

La première partie sera sur les résultats de ma thèse, sur le projet DiOGenes. Je présenterais l’imputation multiple hot-deck une méthode d’imputation qui permet d’imputer des individus en entier afin d’améliorer la qualité de l’inférence de réseaux et qui nécessite d’utiliser des données auxiliaires. Puis dans un second temps, je présenterais l’intégration de données transcriptomiques (mesurées par QuantSeq) et de données cliniques en utilisant une approche basée sur de l’inférence de réseaux. La seconde partie porte sur le projet ProMetIS. Le sujet porte sur l’intégration de données protéomiques et métabolomiques mesurées par LC-MS via notamment l’utilisation d’approches multi-blocs (MOFA, RGCCA/sGCCA).