Restauration de séquences d'activités des cervidés à partir de données d'accélérométrie par des modèles de semi-markov cachés

Résumé : Dans cette présentation, je vous parlerai d’un travail en cours avec des éthologues du CEFS (centre d’étude de la faune sauvage), en collaboration avec Nathalie Peyrard. Nous travaillons sur des données collectées sur des chevreuils, pour lesquels nous disposons simultanément de séquences d’activités (course, alimentation, etc) extraites de vidéos, et de données d’accélérométrie (mesures de l’accélération instantanée en trois dimensions par un collier). L’objectif est de reconstituer les séquences d’activités d’animaux sauvages pour lesquels on ne dispose que des données d’accélérométrie. Cette approche constituerait une avancée significative par rapport aux analyses actuelles qui fournissent uniquement une répartition du temps consacré à chaque activité sur une période donnée.
Pour cela, nous travaillons sur une approche par modèles de semi-markov cachés`(HSMM); Les questions posées incluent notamment le regroupement d’activités finement détaillées en des classes plus grossières, ainsi que des questions sur la restauration des séquences, plus spécifiques aux HSMM. L’enjeu est de sélectionner des méthodes stats et des critères de validation qui répondent aux questions des éthologues. et prennent en compte leurs a priori. Il s’agit d’un travail en cours, donc l’exposé comportera plus de questions que de réponses 😊