Philippe Bordron et Julien Touchais (séminaire interne)
Résumé : L’épitranscriptomique est à la transcriptomique ce que l’épigénomique est à la génomique : l’étude des modifications de l’ARN. Près de 170 modifications des ARN sont aujourd’hui répertoriées. snoBoard est un catalogue qui a pour objectif de répertorier certaines de ces modifications qui sont guidées par des petits ARN non codants. Construit sous la forme d’une base de connaissance et d’une interface web pour explorer les données, l’outil s’appuie sur GraphQL pour fournir une API aisément exploitable, Neo4j pour représenter les données sous forme de graphe de manière performante, et Vue.js pour construire une application web moderne et modulaire. snoBoard permet ainsi de parcourir la base de façon conviviale, produire des représentations graphiques avancées ou réaliser des analyses comparatives sur les ARN modifiés, tout en fournissant des accès programmatiques efficaces pour une exploration et une exploitation automatisée des données.